Das erwartet Sie
Projektbeschreibung
Ziel dieses Promotionsprojekts ist es, transkriptionelle und post-transkriptionelle Regulationsmechanismen in neuroendokrinen Systemen aufzuklären, mit besonderem Fokus auf nicht-kodierende RNAs. Das Projekt verbindet die Entwicklung und Anwendung computergestützter Methoden mit der Analyse und Integration großskaliger, hochdimensionaler biologischer Datensätze aus Gehirngeweben.
Die/der Kandidat*in arbeitet mit komplexen Datensätzen, die mehrere biologische und technische Kovariaten enthalten, und trägt zur Rekonstruktion RNA-vermittelter regulatorischer Netzwerke bei. Das Projekt umfasst integrative Multi-Omics-Analysen, fortgeschrittene statistische Modellierung sowie den gezielten Einsatz von Machine-Learning-Methoden, sofern diese biologisch sinnvoll sind. Die enge Zusammenarbeit mit experimentellen Partnern gewährleistet eine starke biologische Verankerung und hypothesengeleitete Datenanalyse.
Das bringen Sie mit
Unbedingt erforderlich:
1. Abgeschlossenes oder bis zum Startdatum abgeschlossenes Masterstudium in Bioinformatik, Biologie, Informatik oder einem verwandten Fach
2. Starkes Interesse und nachgewiesene Erfahrung in der Analyse von Omics-Daten
3. Sehr gute Programmierkenntnisse in Python oder R sowie Bash
4. Sicherer und routinierter Umgang mit Linux-basierten Rechenumgebungen
5. Sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift
Wünschenswert:
6. Erfahrung mit großskaligen biologischen Datensätzen (z. B. Transkriptomik, Small-RNA-Daten, Proteomik oder verwandte Daten)
7. Erfahrung mit multi-parametrischen bzw. multi-kovariaten statistischen Modellen
8. Vertrautheit mit CLIP-seq-basierten Methoden (z. B. miR-eCLIP)
9. Hintergrund oder starkes Interesse an Neurowissenschaften oder RNA-Biologie
Das bieten wir Ihnen
10. Eine voll finanzierte Promotionsstelle über 3 Jahre in einem kooperativen und anregenden Forschungsumfeld
11. Integration in die Core Unit Bioinformatics, eine große, internationale und interdisziplinäre Gruppe aus Bioinformatikerinnen, Softwareentwicklerinnen, Physikerinnen, Statistikerinnen und Lebenswissenschaftler*innen
12. Eine freundliche, offene und kollaborative Arbeitsatmosphäre mit starkem kollegialem Austausch
13. Einen Arbeitsplatz im Zentrum Berlins mit exzellenter Infrastruktur und enger Anbindung an experimentelle Forschungsgruppen
14. Zugang zu modernsten Rechenressourcen und hochwertigen Multi-Omics-Datensätzen
15. Möglichkeiten zum Aufbau fundierter Expertise in RNA-Biologie, transkriptioneller und post-transkriptioneller Regulation sowie fortgeschrittener Bioinformatik
16. Teilnahme an strukturierten Promotions- und Weiterbildungsprogrammen im Rahmen von BIH und Charité
17. Entgeltgruppe E13 TVöD VKA-K. Die Eingruppierung erfolgt unter Berücksichtigung der Qualifikation, die jeweilige Erfahrungsstufe errechnet sich aus der Berufserfahrung. Das Jahresgehalt (brutto) ist für eine Vollzeitstelle ohne Sonder- oder Zusatzzahlungen angegeben. Den Tarifvertrag finden Sie
18. Zusätzliche im öffentlichen Dienst übliche Leistungen (u.a. Jahressonderzahlung, betriebliche Altersvorsorge (VBL), vermögenswirksame Leistungen)
19. Flexible Arbeitszeiten und Möglichkeit des mobilen Arbeitens
20. 30 Urlaubstage pro Jahr (bei einer Fünf-Tage-Woche)
21. Diverse Unterstützungsangebote um Berufsleben und Familie zu vereinbaren (Kinderbetreuung, Kooperation mit voiio)
22. Sehr gute Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten
23. Mobiles Bürgeramt vor Ort
24. Corporate Benefits (Reisen, Freizeit, Shopping uvm.), Charité Gympass, JobRad
25. Sehr gut erreichbarer und attraktiver Arbeitsplatz am Rahel Hirsch Center for Translational Medicine, Luisenstr. 65, 10117 Berlin