Ihre Aufgaben:
In dieser Position arbeiten Sie in einem interdisziplinären Team aus HPC-, ML- und Biomedizin-Expert:innen. Sie bringen Ihre individuellen Stärken ein und entwickeln sich in benachbarten Feldern weiter. Abhängig von Ihrem Profil können Sie Schwerpunkte setzen – z. B. auf skalierbares Training, Daten-/Feature-Pipelines oder modellseitige Weiterentwicklung – und dabei eng mit Helmholtz Munich, MDC Berlin und NVIDIA zusammenarbeiten.
Sie werden
1. großskalige Trainings- und Inferenzläufe für Foundation Models auf JUPITER aufsetzen und optimieren (Multi-GPU/-Node, Mixed Precision, Parallelisierung, I/O-Optimierung)
2. multimodale Datenquellen (z. B. scRNA-seq, ATAC-seq, Spatial Transcriptomics,.. ) in die Modellierung integrieren und leistungsfähige Daten-/Trainingspipelines entwickeln
3. Anwendungsfälle mit Helmholtz Munich, MDC Berlin und NVIDIA vorantreiben – etwa Krankheitsmodellierung, Vorhersage von Zellzuständen oder Patient:innenstratifizierung
4. zur Weiterentwicklung der Modellarchitekturen (z. B. Transformer, multimodale Fusion, generative Modelle) beitragen
5. Ergebnisse auf Konferenzen präsentieren und in peer-reviewten Journals veröffentlichen
Ihr Profil:
6. Wissenschaftliches Hochschulstudium (Master), vorzugsweise mit anschließender Promotion (PhD) in Informatik, Naturwissenschaften, Mathematik o. ä. mit sehr guter wissenschaftlicher Qualifikation, dokumentiert durch Publikationen in einschlägigen Fachjournalen; ausgeprägter quantitativer/statistischer Hintergrund (z. B. Wahrscheinlichkeitstheorie, lineare Algebra, Optimierung)
7. Starke Expertise in mindestens einem der folgenden Bereiche und Bereitschaft, die übrigen im Team zu vertiefen: Hochleistungsrechnen (verteilte Systeme, Profiling, Performance-Optimierung), Training großer KI-Modelle (PyTorch/JAX/TensorFlow, Parallelisierung, Mixed Precision), Datenanalyse/Statistik (Experimentdesign, Auswertung, Unsicherheitsquantifizierung)
8. Sehr gute Programmierkenntnisse in Python (C/C++ von Vorteil); Erfahrung mit HPC-Umgebungen (z. B. SLURM) ist willkommen
9. Interesse an biologischen Fragestellungen und Freude an interdisziplinärer Zusammenarbeit
10. Sehr gute Englischkenntnisse; Deutschkenntnisse sind ein Plus
11. Wünschenswert wären Erfahrung mit multimodalen Omics-Daten (z. B. scRNA-seq, ATAC-seq, Spatial Transcriptomics, CITE-seq) oder medizinischen Bilddaten (H&E)
12. Ebenfalls wünschenswert wären Beiträge zu Open-Source-Projekten, Benchmarks oder Repro-Pipelines
Unser Angebot:
Wir arbeiten an hochaktuellen gesellschaftlich relevanten Themen und bieten Ihnen die Möglichkeit, den Wandel aktiv mitzugestalten! Sie erwartet ein vielseitiges Angebot:
13. WISSEN & WEITERBILDUNG: Umfassende Trainingsangebote und individuelle Möglichkeiten zur persönlichen und fachlichen Weiterentwicklung
14. GESUNDHEIT & WOHLBEFINDEN: Ihre Gesundheit liegt uns am Herzen. Freuen Sie sich auf ein umfangreiches betriebliches Gesundheitsmanagement mit vielfältigen Angeboten – z. B. durch Beachvolleyball-Platz, Laufgruppen, Yoga-Kurse und vieles mehr. Zusätzlich stehen Ihnen unser betriebsärztlicher Dienst sowie ein erfahrenes Team der Sozialberatung direkt vor Ort zur Seite
15. WORK-LIFE-BALANCE: Die Möglichkeit zum (orts-)flexiblen Arbeiten ist grundsätzlich nach Abstimmung und im Einklang mit den anstehenden Aufgaben und (Vorort-)Terminen gegeben
16. FLEXIBILITÄT: Flexible Arbeitszeitmodelle inklusive vollzeitnaher Optionen ermöglichen eine individuelle Gestaltung Ihrer Arbeitszeit. Mehr dazu unter:
17. URLAUB: Sie erhalten bei uns 30 Tage Urlaub plus freie Brückentage ( zwischen Weihnachten & Neujahr)
18. FAIRE VERGÜTUNG: In Abhängigkeit von Ihren vorhandenen Qualifikationen und je nach Aufgabenübertragung erfolgt eine Eingruppierung im Bereich der Entgeltgruppe 13 TVöD-Bund. Alle Informationen zum Tarifvertrag des TVöD-Bund finden Sie auf der Seite des BMI: Die monatlichen Entgelte in Euro finden Sie gebündelt hier:
Die Position ist auf 2 Jahre befristet. Neben spannenden Aufgaben und einem kollegialen Miteinander bieten wir Ihnen noch viel mehr:
Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, hinsichtlich Alter, Geschlecht, Behinderung, sexueller Orientierung / Identität sowie sozialer, ethnischer und religiöser Herkunft. Ein chancengerechtes, diverses und inklusives Arbeitsumfeld, in dem alle ihre Potentiale verwirklichen können, ist uns wichtig.
Weitere Informationen zu Vielfalt und Chancengerechtigkeit: sowie zur gezielten Förderung von Frauen:
Wir freuen uns auf Ihre Bewerbung. Die Position ist bis zur erfolgreichen Besetzung ausgeschrieben. Bitte bewerben Sie sich daher möglichst zeitnah.
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