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Data scientist als projektmanager (m/w/d)

Groß Buchholz
Medizinische Hochschule Hannover
Data Scientist
Inserat online seit: 7 Mai
Beschreibung

Über uns Die MHH hat eine zentrale, vereinigte Biobank ( Hannover Unified Biobank = HUB) im Clinical Research Center Hannover (CRC) etabliert. Die HUB ist verantwortlich für die systematische, hochqualitative Sammlung, Asservierung, Lagerung und Herausgabe von Biomaterialien (u. a. DNA, Serum, Plasma, Vollblut, Mikroorganismen und Gewebe, aber auch Kits und Antikörper etc., humanen, tierischen oder technischen Ursprungs) und der dazugehörigen Qualitätsmerkmale der Bioproben, sowie ein Minimaldatensatz (Geschlecht, Geburtsjahr, Diagnose) zu den Patient:innen bzw. Probanden. Sonstige klinische und Analysedaten werden in separaten Datenbanken verwaltet. Die HUB ist eine interdisziplinäre Serviceeinrichtung der MHH, welche die Aufgabe hat, die Mitgliedsinstitute und -kliniken sowie die internen als auch externen Kooperationspartner:innen bei der Durchführung von Forschungsprojekten zu unterstützen. Die Probeneignerschaft und die Zugangsrechte auf die Proben und Daten wird durch die Übergabe an die HUB nicht verändert. Zur Realisierung dieser Aufgaben bedient sich die HUB einer hochmodernen Biobankinfrastruktur, sowie einer einheitlichen und standardisierten IT-Plattform. Das Ziel der HUB ist es, mit hochqualitativen Biomaterialien einen wichtigen Beitrag zur Optimierung der translationalen Medizinforschung zu leisten. Die HUB ist den jeweils gültigen datenschutzrechtlichen und ethischen Grundsätzen verpflichtet und trägt auch mittels dieser Geschäftsordnung dafür Sorge, dass die einschlägigen Vorschriften und Standards, im Besonderen auch die Regeln der guten wissenschaftlichen Praxis, von allen Beteiligten der HUB eingehalten werden. Mitarbeit bei der Konzeption und dem Aufbau der Adapt Biodatenbank (BDB) als zentrale Plattform für die Integration und Bereitstellung hochdimensionaler Analysedaten (insbesondere OMICs-Daten) aus Bioproben Harmonisierung und Standardisierung von Metadaten für diagnostische Untersuchungs- und experimentelle Analysemethoden unter Berücksichtigung bestehender (inter-) nationaler Standards (bzw. Entwicklung dieser) Entwicklung und Implementierung von QC- und Annotationspipelines zur standardisierten Dateningestion (ETL) in die Adapt BDB Mitarbeit an der Definition und Priorisierung von Laborverfahren, Auswertungsmethoden und Metadatenstandards für OMICs-Analysetypen (z. B. Genomics, Proteomics, Metabolomics) Unterstützung bei Anforderungs- und Marktanalysen Mitwirkung an der Anbindung des OMICs-/Analysedaten-Repositories an zentrale Analyseumgebungen (z.B. TRE/SPE) Definition und Etablierung von Prozessen und Schnittstellen für Datenflüsse in Abstimmung mit weiteren Infrastrukturen Zusammenarbeit mit regionalen, nationalen und internationalen Netzwerken und Partner:innen abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master oder Diplom) in Bioinformatik, Data Science, Biologie, Molekularbiologie, Naturwissenschaften oder einem vergleichbaren Fachgebiet, vorzugsweise mit Promotion fundierte Erfahrung in der Verarbeitung und Analyse hochdimensionaler biologischer Daten (z. B. Genomics, Proteomics, Metabolomics oder vergleichbare OMICs-Technologien) ist wünschenswert gute Kenntnisse in Programmierung (z. B. Python, Golang, R, Java) sowie Erfahrung im Umgang mit Datenbanksystemen und ETL-Prozessen ist wünschenswert Kenntnisse gängiger Metadatenstandards im Biobanking (z. B. SPREC, MIABIS) und Omics-Datenmanagement (z. B. GHGA) und der FAIR-Prinzipien sind von Vorteil Erfahrung in der Arbeit mit verteilten Forschungsinfrastrukturen oder in multizentrischen Projekten ist wünschenswert sehr gute Deutsch- und Englischkenntnisse in Wort und Schrift ausgeprägte Teamfähigkeit, Eigeninitiative und eine strukturierte, lösungsorientierte Arbeitsweise Bereitschaft zur interdisziplinären Zusammenarbeit in einem nationalen Netzwerk sowie zu gelegentlichen Dienstreisen eine zunächst bis zum 31.12.2029 befristete Teilzeit geeignete Vollzeitstelle mit bis zu 38,5 Wochenstunden bei einem der größten Arbeitgeber des Landes Niedersachsen je nach persönlicher Qualifizierung ist eine Vergütung bis zur Entgeltgruppe E 13 gemäß TV-L möglich mit den Vorteilen des öffentlichen Dienstes (z. B. betriebliche Altersvorsorge und Zusatzversicherung durch VBL) eine reizvolle Tätigkeit an der Schnittstelle von Forschung, Versorgung und Wissenschaftsmanagement eine kollegiale Einarbeitung in einem motivierten und interdisziplinär aufgestellten Team persönliche und berufliche Entwicklungsmöglichkeiten - unterstützt durch unsere vielfältigen internen wie externen Fort- und Weiterbildungsangebote sehr gute Anbindung mit den öffentlichen Verkehrsmitteln sowie die Möglichkeit zum Dienstrad Leasing ein ausgezeichnetes Angebot an Sport-, Beratungs- und Vorsorgeprogrammen - weil Deine Gesundheit uns am Herzen liegt

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