Wir suchen zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine/n
Masterstudent/in (w/m/d)
für eine Masterarbeit zum Thema: Optimierung der Strukturanalytik und Quantifizierung von Lipid A und LPS Gram-negativer Bakterien.
Das Forschungszentrum Borstel ist das Lungenzentrum in der Leibniz Gemeinschaft. Wir sind ein international agierendes, von Bund und Ländern finanziertes Wissenschaftsunternehmen. Unsere zentrale Aufgabe ist die Grundlagen- und translationale Forschung auf dem Gebiet der Atemwegserkrankungen. Wir betreiben umfangreiche Labor- und Forschungsinfrastrukturen. Akademisch sind wir mit den benachbarten Universitäten und klinisch mit dem Universitätsklinikum Schleswig-Holstein eng verbunden. Wir haben ein Ziel: Bestehende Methoden zur Erkennung, Vermeidung und Behandlung von Lungenerkrankungen zu verbessern und neue, innovative Therapieansätze zu entwickeln.
Lipopolysaccharide, kurz LPS, sind chemische Verbindungen, die aus Zucker- und Lipideinheiten aufgebaut sind, und ein integraler Bestandteil der äußeren Membran der Zellwände Gram-negativer Bakterien. Die Ankerstruktur des LPS, das Lipid A, ist bekannt dafür im Zuge der Ausbildung von Antibiotikaresistenzen durch die Bakterien modifiziert zu werden. Das Ziel dieser Arbeit ist es daher, ein optimiertes Schnellextraktionssystem für LPS und Lipid A, v.a. an P. aeruginosa und E. coli-Stämmen zu testen, sowie die massenspektrometrische Quantifizierung von Lipid A durch die Generation spezifischer Standards zu verbessern.
IHRE AUFGABEN
1. Nasschemische Isolierung bakterieller Lipopolysaccharide (inklusive Bakterienkultivierung im BSL2-Labor)
2. Chemische Derivatisierung der isolierten Lipopolysaccharide sowie Isolierung von Partialstrukturen (v.a. Lipid A)
3. Anwendung verschiedener chromatografischer Analyse- und Trenn-Verfahren (HPLC, GPC, TLC, PAGE)
4. Strukturcharakterisierung und Quantifizierung der Moleküle mittels hochauflösender Massenspektrometrie
IHRE KOMPETENZEN
5. Sie studieren Chemie, Biochemie oder einen vergleichbaren Studiengang mit chemischem Hintergrund
6. Sie gehen sicher mit chemischen Gefahrstoffen um und haben grundlegende Erfahrungen in chromatografischen Techniken
7. Sie verfügen über grundlegende Kenntnisse in der Auswertung von MS-Spektren
8. Sie sollten sich in der englischen Sprache wohlfühlen