Berufliche Herausforderung: Als Wissenschaftler/in für molekulare Untersuchungen mikrobieller Ökologie in Manganknollen-Ökosystemen der Tiefsee sind Sie Teil eines interdisziplinären Teams, das sich mit den Auswirkungen des Abbaus polymetallischer (Mangan)Knollen auf benthische Tiefsee-Lebensgemeinschaften beschäftigt.
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Hintergrund: Der Abbau von Mangan-Knollen ist ein komplexes Thema, das wissenschaftliche Forschung erfordert. In Rahmen des JPI-Oceans-Projekts MiningImpact führt die Gruppe Tiefseeökologie und -technologie Arbeiten zu den Auswirkungen des Knollenabbaus durch. Ziel ist es, Industrietest im Jahr 2021 in der Clarion-Clipperton-Frachture-Zone (CCZ) im subtropischen Ostpazifik durchzuführen.
Projektziel: Die Arbeit konzentriert sich auf Bakterien- und Archaeengemeinschaften am Meeresboden in der CCZ. Ein einzigartiger Datensatz mit DNA-/RNA-Sequenzen (Metabarcodes, Metagenome und Metatranskriptome aus Sedimenten, Bodenwasser und Manganknollen) bildet die Grundlage der Arbeit. Weitere Probenahmen und Messungen werden durchgeführt, um die Auswirkungen des Kollektortests auf längeren Zeitskalen zu untersuchen.
Aufgaben:
* Für die erforderlichen bioinformatischen Analysen verantwortlich
* Die Ergebnisse dieser Analysen auszuwerten und über die taxonomische und funktionelle Vielfalt der mikrobiellen Gemeinschaften Kenntnis zu erlangen
* Auswertung der Informationen aus molekularen Daten unter Verwendung geeigneter statistischer Verfahren
* Erforschung potenzieller Indikatoren für die Beeinträchtigung der Ökosysteme und möglicherweise eine anschließende Erholung
* Veröffentlichung und Präsentation der Ergebnisse in wissenschaftlichen Fachzeitschriften und auf Konferenzen
* Mitwirkung an integrierten, multidisziplinären Analysen im Projektkonsortium und zu gemeinsamen Veröffentlichungen und Berichten
* Durchführung mikrobieller Probenahmen, Laborinkubationen, Extraktionen und Analysen
Voraussetzungen:
* Promotion in mariner mikrobieller Ökologie mit Schwerpunkt auf molekularer Ökologie oder ökologischer Genomik oder eng verwandten Themen – idealerweise mit Schwerpunkt Tiefsee
* Berufserfahrung als Postdoc (mindestens 2 Jahre) und nachgewiesene Erfahrung im wissenschaftlichen Publizieren
* Umfassende Kenntnisse in der bioinformatischen Analyse taxonomischer und funktioneller Biodiversität und der kodierten/exprimierten Stoffwechselwege mariner mikrobieller Gemeinschaften
* Fachkenntnisse in bioinformatischen Werkzeugen und Pipelines für die Datenvorverarbeitung, die Erstellung von Amplicon Sequence Variant-Tabellen, die Rekonstruktion von Genen/Genomen, die Vorhersage der phylogenetischen Herkunft von DNA-Sequenzen und Genen, die Klassifizierung molekularer Features und das Clustering von Proteinen auf der Grundlage von Struktur und Funktion
* Kenntnisse in R, Python, Unix/Linux-Command-Line Tools und der Automatisierung von Arbeitsabläufen
* Umfangreiche Kenntnisse der relevanten Metriken und Methoden zur Analyse natürlicher mikrobieller Gemeinschaften und Funktionen und ihrer räumlich-zeitlichen Muster
* Umfassende Kenntnisse der relevanten molekularen Datenbanken für taxonomische und funktionelle Annotationen
* Fundierte Fachkenntnisse der molekularen Laborarbeit, einschließlich DNA/RNA-Extraktion, PCR und Erstellung von Bibliotheken für NGS
* Fähigkeit, unabhängig und in Kooperation mit den Projektpartnern zu arbeiten
* Bereitschaft zur Teilnahme an Expeditionen sowie internationalen Reisen zu Projekttreffen und Konferenzen
* Ausgeprägte Kommunikations- und Teamfähigkeit
* Hervorragende Englischkenntnisse in Wort und Schrift
Zusätzliche Vorteile:
* Teamarbeit und internationale Zusammenarbeit
* Möglichkeit zur Fortbildung und Entwicklung auf der eigenen Stelle
* Flexible Arbeitszeiten
* Unterstützungsangebote für Vereinbarkeit von Beruf und Familie
* Modernes Laborumfeld
* Weiterentwicklungsmöglichkeiten
* Optionale Aufenthalte im Ausland
* Arbeitsplatz in einem multikulturellen Umfeld
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