Wir suchen zum nächstmöglichen Zeitpunkt für ein zeitlich befristetes Projekt einen Bioinformatiker (m/w/d) mit ausgewiesener Expertise im Bereich Next Generation Sequencing (NGS) in Vollzeit. Du hast Lust, Teil eines führenden Ringversuchsanbieters auf dem nationalen und internationalen Markt zu werden? Du möchtest in einem herzlichen Team und einer flachen Hierarchie arbeiten? Dein Herz schlägt für die Wissenschaft und Forschung und du setzt alles daran, mittels neuester Technologien den Weg in die Zukunft zu ebnen? Dann bist du bei uns genau richtig! Wir, das ist die Stiftung für Pathobiochemie und Molekulare Diagnostik (SPMD) mit dem Referenzinstitut für Bioanalytik (RfB) Die SPMD ist eine Stiftung des bürgerlichen Rechts mit dem Ziel der Förderung der medizinischen Wissenschaft und Forschung sowie der öffentlichen Gesundheitspflege. Sie betreibt das Referenzinstitut für Bioanalytik im Rahmen der Qualitätssicherung in medizinischen Laboratorien. Zu diesem Zweck führt das RfB Ringversuche zur externen Qualitätskontrolle für das gesamte Gebiet der Labormedizin durch. Inhalt und Bewertungskonzept eines großen Teils dieser Ringversuche ist durch die Richtlinie der Bundesärztekammer (Rili-BAK) vorgegeben. Darüber hinaus bietet das RfB jedoch noch eine Vielzahl weiterer Ringversuche an, deren Zuschnitt und Weiterentwicklung durch unser External Quality Assurance Scheme (EQAS-Board) verantwortet wird. Durchführung und Entwicklung bioinformatischer Analysen aus NGS-Daten (z.B. Illumina, Nanopore, PacBio) mithilfe von R und Command-Line-Tools Entwicklung, Optimierung und Pflege von Analyse-Pipelines sowie Entwicklung eigener Software-Tools und Packages in R Qualitätskontrolle, Prozessierung und Aufbereitung von NGS-Daten für die weiterführende medizinische oder wissenschaftliche Auswertung Funktionelle und strukturelle genomische Analysen (z.B. Variant Calling, Genexpressionsanalysen, Annotationen) Benchmarking und Validierung von Auswerteworkflows sowie Dokumentation der Ergebnisse Mitarbeit und Unterstützung bei der Erstellung wissenschaftlicher Publikationen Integration weiterer Datenquellen (z.B. klinische Daten, Metadaten) zur Interpretation der NGS-Ergebnisse Kommunikation und enge Zusammenarbeit mit einem interdisziplinären Team aus Biologie, Medizin und IT Abgeschlossenes Hochschulstudium in Bioinformatik, Informatik, Biologie oder einem verwandten Bereich Umfangreiche Kenntnisse und Praxiserfahrung mit bioinformatischen Analysen, speziell im Bereich NGS Erfahrung in der Anwendung von R (inkl. Package Development) und Command-Line-basierten Analysewerkzeugen (z.B. Bash, Python) Sicherer Umgang mit Methoden der Qualitätskontrolle und statistischen Auswertungen in großen genomischen Datensätzen Idealerweise Erfahrung mit öffentlichen Sequenzdatenbanken, Algorithmen zur Fehlerkorrektur und fortgeschrittenen Auswertemethoden bei NGS Teamfähigkeit, eine strukturierte Arbeitsweise sowie Kommunikationsgeschick auf Deutsch und Englisch Die Möglichkeit, an einem innovativen, praxisnahen Forschungsprojekt auf hohem methodischem Niveau mitzuwirken und methodisch wie publizistisch sichtbar zu werden Flache Hierarchien in einem kleinen Team mit gemeinsamer Mission Eine flexible Arbeitszeitgestaltung ohne Schichtarbeit Ein individuelles Onboarding mit einer umfassenden Einarbeitung Weitere Vorteile wie z. B. 303 Urlaubstage im Jahr, ein bezuschusstes Deutschlandticket, ein umfassendes Gesundheits- und Fitnessangebot und vieles mehr