Bioinformatiker / Bioinformatikerin / Computational Biologist (m/w/d)
am Institut für Klinische Chemie und Laboratoriumsmedizin
Am Institut für Klinische Chemie und Laboratoriumsmedizin des Universitätsklinikums Dresden ist zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine Stelle als Bioinformatiker / Bioinformatikerin / Computational Biologist (m/w/d)) mit dem Schwerpunkt Analyse komplexer Omics-Datensätze und Multi-Omics-Integration und Analyse und Integration von Omics-Datensätzen in der translationalen Forschung in Voll- oder Teilzeitbeschäftung zunächst befristet für 24 Monate zu besetzen. Die Vergütung erfolgt nach den Eingruppierungsvorschriften des Tarifvertrages für den öffentlichen Dienst (TV-L) und ist bei Vorliegen der persönlichen Voraussetzungen in die möglich.
Ihre Aufgaben:
* Analyse, Integration und Interpretation von hochdimensionalen Omics-Datensätzen im Kontext translationaler Forschungs- und Diagnostikprojekte
* Bioinformatische Auswertung von
o bulk RNA-Sequenzierung
o Single-Cell- und Single-Nucleus RNA-Seq
o CITE-Seq
o ATAC-Seq
o NGS-basierten Datensätzen
o Metabolomics- und Proteomics-Daten
* Entwicklung, Erweiterung und Wartung von Analysepipelines für Omics-Daten (inkl. Qualitätskontrolle, Normalisierung, Annotation und statistischer Auswertung)
* Multi-Omics-Integration (z. B. Transkriptomik–Epigenomik–Metabolomik–Proteomik) zur Ableitung biologisch und klinisch relevanter Hypothesen
* Enge Zusammenarbeit mit experimentellen Wissenschaftler:innen, Kliniker:innen und Diagnostiker:innen
* Unterstützung bei der methodischen Implementierung bioinformatischer Workflows in translationalen und ggf. kliniknahen Kontexten
* Mitwirkung bei der Erstellung wissenschaftlicher Publikationen, Drittmittelanträgen und Präsentationen
Ihr Profil:
* Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium mit Promotion (z. B. Bioinformatik, Computational Biology, Systembiologie, Biostatistik, Molekulare Medizin oder verwandte Fachrichtungen)
* Ausgewiesene praktische Erfahrung in der Analyse von Omics-Datensätzen, insbesondere:
o bulk und single-cell RNA-Seq
o CITE-Seq und/oder ATAC-Seq
o idealerweise Metabolomics und/oder Proteomics
* Sehr gute Programmierkenntnisse in R, Erfahrung mit relevanten Bioconductor-Frameworks (z. B. Seurat, SingleCellExperiment, edgeR, DESeq2)
* Gute bis sehr gute Kenntnisse in Python (z. B. Scanpy, Pandas, NumPy, SciPy)
* Erfahrung im Aufbau, der Anpassung und Dokumentation von reproduzierbaren Analysepipelines (z. B. mit Snakemake, Nextflow, Git)
* Verständnis für statistische Methoden, Datenintegration und Visualisierung komplexer Datensätze
* Strukturierte, eigenständige Arbeitsweise sowie ausgeprägte Team- und Kommunikationsfähigkeit
* Interesse an translationaler Forschung und der Anwendung bioinformatischer Methoden im medizinischen Kontext
Wir bieten:
* Mitarbeit an wissenschaftlich und klinisch hochrelevanten Projekten im Bereich chronisch-inflammatorischer Erkrankungen und Krebsforschung
* Ein interdisziplinäres Umfeld mit enger Anbindung an klinische Partner
* Moderne IT- und Analyseinfrastruktur
* Möglichkeit zur wissenschaftlichen Weiterqualifikation (inkl. Habilitation)
* Attraktive Angebote zur Gesundheitsförderung (Carus Vital)
* Umfangreiche Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten über die Carus Akademie
* Betriebliche Altersvorsorge
* Nutzung des Jobtickets für den öffentlichen Nahverkehr in Dresden und Umgebung
Ihre Ansprechpartnerin der
Direktion Human Resources für Rückfragen
Elena Koch
Tel.: 0351-458 2594