Die Medizinische Fakultät der Universität Leipzig gehört mit ihrer über 600-jährigen Tradition zu den größten Forschungseinrichtungen der Region Leipzig. Mit über 1.300 Mitarbeiterinnen und Mitarbeitern ist sie die größte von insgesamt 14 Fakultäten der Universität Leipzig und dient als Ausbildungsstätte für ca. 3.500 Studierende der Human- und Zahnmedizin sowie der Pharmazie und Hebammenkunde.
Wissenschaftlicher Mitarbeiter / Bioinformatiker (m/w/d) Institut für Humangenetik
Einrichtung: Department für Diagnostik, Institut für Humangenetik
Anstellungsart: Befristet bis 31.08.2027, Drittmittelverfügbarkeit
Arbeitsdauer: Teilzeit (30,00 h)
Arbeitsbeginn: zum nächstmöglichen Zeitpunkt
Vergütung: TV-L EG 13
Die Aufgaben
Als Mitglied unseres Teams sind Sie für die Verarbeitung und Analyse genomischer Sequenzdaten verantwortlich, insbesondere im Hinblick auf die Berechnung und Anwendung Polygener Scores (PGS).
- Pipeline aufsetzen und implementieren: Aufbau einer automatisierten Bioinformatik-Pipeline zur Verarbeitung von Short-Read-Genom-Sequenzierungsdaten. Ziel ist die Generierung annotierter VCF-Dateien.
- Genetische Variantenextraktion: Systematische Identifizierung und Extraktion spezifischer genetischer Varianten (SNPs), die als Input für verschiedene Polygene Scores (PGS) benötigt werden.
- Berechnung und Validierung von PGS: Berechnung, Kalibrierung und Validierung unterschiedlicher PGS-Modelle für relevante phänotypische Merkmale oder Erkrankungen. Ein tiefes Verständnis der Methodik hinter PGS ist hierfür essentiell.
- Risikomodellierung: Reproduktion und Weiterentwicklung von publizierten statistischen Modellen zur Berechnung kombinierter Risiken: monogen, PGS und weitere Daten, z. B. anthropometrische Daten, Familienanamnese oder Umweltfaktoren.
Ihr Profil
* erfolgreich abgeschlossenes Hochschulstudium (Master oder Promotion) in Bioinformatik, Biostatistik, genetischer Epidemiologie oder einem verwandten Fachgebiet. Alternativ ein abgeschlossenes Biologie- oder Biochemiestudium mit nachweisbarer Expertise in den o. g. Aufgaben.
* Expertise und tiefes methodisches Verständnis im Bereich Polygenic Scores (PGS).
* praktische Erfahrung in der Analyse von Genom-Sequencing samt gängiger Bioinformatik-Tools
* sehr gute Programmierkenntnisse in R und/oder Python sowie Erfahrung in der Skripterstellung und Arbeit auf High-Performance-Computing (HPC)-Clustern (Linux-Umgebung).
* Sinn für geschäftliches Denken
* bevorzugt wohnhaft in Leipzig
Das bieten wir Ihnen
Zunächst ist eine Teilzeitstelle für 12 bis 15 Monate vorgesehen. Die Umgebung ist akademisch mit einem Start-up-Charakter. Die Arbeit findet hauptsächlich mit den vier Hauptakteur:innen statt, jedoch ist eine Interaktion mit dem gesamten Team des Instituts für Humangenetik ein elementarer Teil der Position.
Die Vergütung ist nach dem Tarifvertrag des öffentlichen Dienstes (TV-L, je nach Qualifikation).
Bei geplanter Anschlussfinanzierung ist bei beidseitigem Interesse eine weiterführende Anstellung möglich und erwünscht.
So bewerben Sie sich
Bitte bewerben Sie sich jetzt bis zum 30.04.2026 auf diese Stelle in unserem Bewerberportal.
Ansprechperson
Auskünfte zum Bewerbungsverfahren erteilt Professor Simone Ahtin g unter 0341/97-22760 bzw. Simone.ahting@medizin.uni-leipzig.de.
Schwerbehinderte Bewerber:innen werden bei gleicher Eignung bevorzugt berücksichtigt. Bitte fügen Sie Ihrer Bewerbung entsprechende Nachweise bei.
Bitte beachten Sie, dass wir aufgrund gesetzlicher Regelungen nur Bewerber:innen einstellen können, die über die Immunität gegen Masern verfügen. Die entsprechenden Nachweise müssen von Ihnen vorgelegt werden.
Hinweise zum Datenschutz finden Sie unter: Datenschutz