Die Stelle im Überblick
1. Sie werden als wissenschaftliche Mitarbeiterin / wissenschaftlicher Mitarbeiter beschäftigt
2. Entwicklung rechnergestützter Methoden zur Integration zirkadianer multimodaler Omics-Daten (Single-Cell- & Bulk-Transcriptomik, Proteomik, Metabolomik, hochdimensionale Zytometrie)
3. Aufbau kuratierter Single-Cell-Datenatlanten aus Konsortiums- und Publikationsdaten sowie einer umfassenden Genexpressionsdatenbank für den SFB
4. Weiterentwicklung unserer interaktiven Datenplattform CircMedDB ( in Zusammenarbeit mit einem Webdesigner
5. Erstellung standardisierter Verarbeitungs-Pipelines für Rohdaten zur Verbesserung der Vergleichbarkeit zwischen den SFB-ProjektenBereitstellung bioinformatischer Expertise und Schulungen für Mitglieder des SFB
6. Sie sind wissenschaftlich tätig: Nach §110 (4), Satz 3 sieht das BerlHG für wissenschaftliche Mitarbeitende eine angemessene Zeit innerhalb der Arbeitszeit für die eigene wissenschaftliche Weiterqualifikation vor
Danach suchen wir
7. Gesucht wird eine Persönlichkeit, die Freude daran hat, nachhaltige bioinformatische Infrastrukturen aufzubauen und qualitativ hochwertige Datenressourcen zu schaffen, um den wissenschaftlichen Impact des Konsortiums zu stärken.
8. Sie verfügen über eine Promotion in Bioinformatik, Computational Biology, Systembiologie oder einem verwandten Fach
9. Erfahrung in der Analyse und Verarbeitung von Omics-Daten
10. Sehr gute Kenntnisse in mindestens einer gängigen Programmiersprache der Bioinformatik (z. B. Python, R)
11. Eigenverantwortlicher, strukturierter und detailorientierter Arbeitsstil
12. Sehr gute Kommunikationsfähigkeiten für Schulungen und interdisziplinäre Zusammenarbeit
13. Von Vorteil sind zudem Erfahrung mit Single-Cell-Omics-Daten und Kenntnisse im Bereich der zirkadianen Biologie
14. Ebenso von Vorteil sind Erfahrung in der Entwicklung webbasierter Anwendungen zur Datenvisualisierung und der Pipeline-Entwicklung und Datenbankmanagement
Das bringt die Charité mit
15. Eigene Projektideen können entwickelt werden
16. Wir bieten ein kooperatives, internationales und kollegiales Arbeitsumfeld mit translationalem Fokus sowie Zugang zu moderner Recheninfrastruktur
17. Vergünstigungen bei vielen Angeboten für Beschäftigte für die Bereiche Shopping, Reisen, Sport
18. Fahrradleasing über JobRad möglich, Velo Klinik mit vergünstigten Preisen für Mitarbeitende am Campus
19. Die Charité ist seit 2007 zertifiziert als familiengerechte Hochschule und familiengerechtes Unternehmen - finden Sie weitere Informationen