Ihre Aufgaben
1. Koordination des Arbeitspakets "NUM-OMICs" im Projekt ENRICH inkl. Organisation, Moderation und Dokumentation von Projekttreffen der beteiligten Partner, Sicherstellen des Fortschritts im Projekt, Berichtswesen
2. Beteiligung an Arbeitsgruppen zur Definition von Metadatenstandards für OMICs-Daten sowie zur Erarbeitung von Umsetzungskonzepten für FAIR Data Management
3. Mitarbeit bei der Erstellung von Datenschutz- und Sicherheitskonzepten für die NUM-OMICs Plattform
4. Mitarbeit bei der Definition von API- und Schnittstellenkonzepten sowie von Mapping- und ETL-Prozessen für Analysedaten aus Bioproben
5. Unterstützung/Vertretung der IT-Administration der Biobank in Routineaufgaben
Unser Angebot
6. Vergütung je nach persönlicher Qualifikation bis zu E13 TV-L
7. befristet (mit Verlängerungsoption) bis zum (§ 14 Abs. 1 Nr. 1 TzBfG)
8. Vollzeit (Teilzeit möglich)
9. interne und externe Fortbildungsmöglichkeiten
10. Vielzahl von Gesundheits-, Beratungs- und Präventionsangeboten
11. Vereinbarkeit von Familie und Beruf
12. flexible Arbeitszeiten
13. gute Verkehrsanbindung
14. betriebliche Zusatzversorgung (VBL)
15. kollegiale Zusammenarbeit
16. offene und angenehme Arbeitsatmosphäre
Ihr Profil Das erwarten wir
17. erfolgreich abgeschlossenes Hochschulstudium in den Bereichen Bioinformatik, Medizininformatik oder Public Health mit Datenfokus
18. alternativ: abgeschlossenes Hochschulstudium der Naturwissenschaften mit Zusatzqualifikation/Kenntnissen im Bereich Informatik/Datenwissenschaften
19. erste Kenntnisse im Projektmanagement
20. Kenntnisse im Datenmanagement und der FAIR-Prinzipien
21. grundlegendes Verständnis für OMICs-Daten sowie Kenntnisse folgender Technologien/Datenarten: Genomik Transkriptomik Microarray-basierte OMICs-Daten
22. Verständnis der Architektur von IT-Plattformen und von Schnittstellenkonzepten
23. fundierte IT-Kenntnisse, insbesondere Workflow-Management-Systeme (z. B. Nextflow, Snakemake) Containerisierung (Docker, Singularity) Cloud- & HPC-Umgebungen ETL-/ELT-Prozesse und Datenpipelines
24. Freude an Teamarbeit, Kommunikationsfähigkeit sowie Fähigkeit zum eigenständigen Arbeiten
25. hohe Eigenmotivation, Sorgfalt und Zuverlässigkeit
26. Gender- und Diversitykompetenz
Das wünschen wir uns
27. Erfahrung/Kenntnisse in: (akademischen) Verbundprojekten Metadatenstandards von OMICs Daten Ethik- und Datenschutzthemen Java (wünschenswert Erfahrung mit Webframework VAADIN) Datenbanken (Relationale Datenbanken / NoSQL) Versionskontrolle (z. B. Git) und Kollaboratives Arbeiten: GitHub, GitLabPython R (wünschenswert Erfahrung mit: ggplot2, heatmap2, DESeq2) Laborinformationsmanagementsystemen (LIMS)
28. sehr gute Englischkenntnisse